En 1998/99, l’école de musique franco-allemande (EMFA) est créée. Par ailleurs, le mercredi matin, des cours d’allemand sont proposés aux enfants des écoles élémentaires françaises. Durant l’année scolaire 2002/2003, la durée totale de la scolarité passe de 13 à 12 années. Ce passage doit s’étaler sur six ans. Les modifications d’organisation qui en découlent, comme par exemple, la mise en place de cours l’après-midi, se font de manière progressive, année après année. Depuis l’année scolaire 2005/2006, les élèves, les enseignants et le personnel administratif disposent d’une cantine. En 2006/2007, la ligne directrice de l’École allemande est votée.

En 1998, 380 enfants sont inscrits à l’école et au jardin d’enfants à St Cloud. Aujourd’hui, ils sont environ 300. Le recul du nombre d’élèves s’explique par une baisse du taux de natalité et par un changement de stratégie et d’implantation des entreprises allemandes. Le nombre de salariés allemands détachés avec leur famille dans des pays européens connaît une baisse sensible. De plus, la création d’écoles bilingues ou multilingues à l’ouest de Paris augmente la concurrence vis-à-vis de l’École allemande.